骨シンチは骨が壊れている部位に集まるお薬を利用し、主に骨への転移を発見するために役立ちます。CTのみでは指摘が難しい骨転移も多く、骨シンチを行うことでより正確に診断をすることが可能になります。

脳血流シンチは脳の血流状態を知ることができる検査です。脳動脈のバイパス術の治療適応を判断したり、また近年では認知症疾患の鑑別に多く使われるようになっています。国内多施設で蓄積された正常データベースと比較することで受験者の脳のどの部位が低下しているのかを詳細に解析していくことでアルツハイマー病などの診断を推定していきます。

特異性の高い薬剤を用いて、副甲状腺腺腫の診断が高い精度にて可能です。CTとの融合画像を作成することにより小さな病変の位置も正確に把握できます。

消化管出血シンチでは内視鏡にての確認が難しい小腸の出血や間欠的出血（ずっと出血するわけでは無く、出血したり止血したりする）の評価に有用な場合があります。造影CTや血管造影にては活動性出血している時に検査をしないと分かりませんが、シンチでは間隔を置いて撮影することで出血の診断が可能となる場合があります。CTとの融合画像を作成することにより、出血部位の推定がより正確になります。

センチネルリンパ節とは、がん病変からはじめに転移すると考えられるリンパ節のことであり、がんの近くに薬剤を注入し、その薬剤の流れからセンチネルリンパ節を割り出し、転移が存在しなければそれ以上のリンパ節郭清を省略するというものです。不必要なリンパ節の摘出を行わないことで術後のリンパ浮腫（腕の腫れなど）による生活の質低下を予防します。乳がんや皮膚がんなどの手術時に利用される方法です。

ドパミン神経の終末部に高発現しているドパミントランスポーターの分布を評価できます。パーキンソン病やレビー小体型認知症などの診断に有用です。

心交感神経シンチ（MIBGシンチ）は長く心不全の評価に使用されてきた薬剤ですが、近年パーキンソン病やレビー小体型認知症にて心臓の集積が高度に低下するということがわかり、脳神経疾患の検査として使用されることが多くなりました。

腎シンチでは腎臓への薬剤集積の様子、尿管から膀胱への薬剤移行を観察することで、腎機能や通過障害の評価ができます。大きな特徴としては血液や尿の検査では難しい、右腎、左腎それぞれの機能を分けて評価ができる点が挙げられます。